Postupné rušení epidemiologických opatření a návrat cestujících do vlaků znamená také postupný návrat k normálu na železnici. Od 15. května se tak na tratích objeví další dálkové spoje. V případě spojů SC Pendolino mezi Prahou a Ostravskem a Jižních expresů mezi Prahou a Českými Budějovicemi půjde o návrat prvních spojů na těchto linkách, v případě jiných, již provozovaných linek pak půjde o ukončení zbývajících omezení a návrat k plánovaným jízdním řádům.
V souvislosti s ukončením režimu omezeného pohybu obyvatel České dráhy po dohodě s Ministerstvem dopravy od neděle 26. dubna 2020 obnoví provoz části dálkových linek. Půjde o spoje Západní expres z Prahy přes Plzeň do Chebu, railjet Vindobona ve vnitrostátním úseku z Prahy do Břeclavi, Krušnohor z Prahy přes Ústí nad Labem do Karlových Varů a Chebu a Valašský expres ve vnitrostátním úseku z Prahy přes Olomouc do Horní Lidče. Obnovení provozu dalších dálkových a regionálních spojů se bude uskutečňovat postupně podle požadavku objednavatelů a rostoucího počtu cestujících. Podrobnosti o obnovených spojích budou od soboty k dispozici také ve vyhledávačích spojení na internetu nebo v aplikaci Můj vlak.
(AKTUALIZOVÁNO 06.03.) Správa železnic posiluje na nádražích informovanost cestujících obdobně, jako je tomu na pražském letišti. Na informačních tabulích a letácích je popsán postup Ministerstva zdravotnictví, co mají lidé dělat v případě, že se vracejí z oblastí nakažených koronavirem. Stejně tak budou k dispozici informace v mezinárodních železničních spojích Českých drah. Doporučení dává Ministerstvo dopravy spolu s Ministerstvem zdravotnictví i ostatním železničním a autobusovým dopravcům.
Vstoupil v platnost nový jízdní řád na železnici a s ním i několik zásadních změn na českých kolejích. Začala platit většina nových smluv na dálkovou dopravu (objednávka Ministerstva dopravy) i na úrovni regionální (objednávka jednotlivých krajů). Pět z 28 rychlíkových linek a některé regionální spoje nově zajišťují jiní dopravci než České dráhy a některé smlouvy na krajské úrovni přešly do režimu „brutto“ (nesení rizik a příležitostí za výnosy na straně objednatele). Kontroloři Ministerstva dopravy již působí přímo v terénu.
Ministr dopravy Vladimír Kremlík dnes podepsal novou desetiletou smlouvu o veřejných službách s Českými dráhami. Byl tak dovršen proces dojednávání nových podmínek zajišťování veřejných služeb.
Od začátku platnosti jízdního řádu 2019/2020, tedy ode dne 15. prosince 2019, může dojít v některých krajích ke změně nabídek jízdních dokladů při odbavování cestujících na železnici.